Het gezin van Superman tracht te wennen aan hun nieuwe omgeving, en de krachten van Jordan die hij volop wil verkennen. Zoals je kan raden loopt niet alles van een leien dakje. In de mijnen ontstaat er een nieuwe bedreiging, die Superman rechtstreeks beïnvloedt. Het hek is volledig van de dam wanneer hij een bizarre versie van zichzelf ontmoet en de hulp van zijn broer nodig heeft.
Voor de familieleden van de superheld is het ook geen lachertje. Jonathan, voormalige rugbyster vindt zijn draai niet in zijn nieuwe school, vooral niet wanneer blijkt dat de nieuwe quarterback 'hulpmiddelen' gebruikt om zijn prestaties te verhogen. Lois connecteert dan weer met haar jongere zus Lucy, die destijds prooi viel aan een sekte. Is zij er volledig uit, of had die sekte toch een kern van waarheid. Dit en meer kom je te weten in het tweede seizoen van Superman and Lois!