Het uitdagende Danger Deck teleporteert de speler naar gloednieuwe locaties in South Park om vijanden te verslaan in holografische gevechten die gemaakt zijn door gadgeteer Tupperware van de Freedom Pals. Toegang tot het Danger Deck krijgt de speler via de Danger Deck-terminal in het Freedom Pals-hoofdkwartier. De gevechten worden steeds moeilijker en laten de superhelden tot het uiterste gaan. De speler vecht tegen een groot aantal verschillende vijanden, onder wie King Crab, Coked-Out Cops, Rebecca the Raisin's Girl en Aunt Sheila. Vervolgens wordt de speler beloond met kostuums en andere items die dan weer gebruikt kunnen worden in andere gevechten in de game.
Danger Deck is onderdeel van de Season Pass of los verkrijgbaar voor €5,99.